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Enregistrement W1972454905 · doi:10.1021/ic010025e

A DNA Oligonucleotide−Hemin Complex Cleaves<i>t</i>-Butyl Hydroperoxide through a Homolytic Mechanism

2001· article· en· W1972454905 sur OpenAlexaff
Paul K. Witting, Paula Travascio, Dipankar Sen, A. Grant Mauk

Notice bibliographique

RevueInorganic Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueElectron Spin Resonance Studies
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryHeminElectron paramagnetic resonanceRadicalPhotochemistryAdductHomolysisNitroxide mediated radical polymerizationSpin trappingHemeOrganic chemistryNuclear magnetic resonanceEnzymeCopolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Both electron paramagnetic resonance (EPR) and electronic absorption spectroscopy have been employed to investigate the reaction of a guanine-rich DNA nucleotide-hemin complex (PS2.M-hemin complex) and organic peroxide (t-Bu-OOH). Incubation of the PS2.M-hemin complex with t-Bu-OOH resulted in the time-dependent decrease in the heme Soret with concomitant changes to the visible bands of the electronic absorbance spectrum for the PS2.M-hemin complex. Parallel EPR studies using the spin trap 5,5-dimethyl-1-pyrroline N-oxide (DMPO) combined with spectral simulation demonstrated the presence of tert-butyloxyl, carbon-centered methyl, and methyl peroxyl radicals as well as a simple nitroxide (triplet) signal. Experiments, performed by maintaining a constant ratio of t-Bu-OOH/PS2.M-hemin complex ( approximately 35 mol/mol) while varying DMPO concentration, indicated that the relative contributions of each radical adduct to the composite EPR spectrum were significantly influenced by the DMPO concentration. For example, at DMPO/PS2.M-hemin of 10-50 mol/mol, a complex mixture of radicals was consistently detected, whereas at high trapping efficiency (i.e., DMPO/PS2.M-hemin of approximately 250 mol/mol) the tert-butyloxyl-DMPO adduct was predominant. In contrast, at relatively low DMPO/PS2.M-hemin complex ratios of < or =5 mol/mol, a simple nitroxide three-line EPR signal was detected largely in the absence of all other radicals. Together, these data indicate that tert-butyloxyl radical is the primary radical likely formed from the homolytic cleavage of the O-O peroxy bond of t-Bu-OOH, while methyl and methyl peroxyl radicals result from beta-scission of the primary tert-butyloxyl radical product.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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