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Enregistrement W1972455024 · doi:10.1074/jbc.m113.463562

β-Glucosidase 2 (GBA2) Activity and Imino Sugar Pharmacology

2013· article· en· W1972455024 sur OpenAlexaff
Christina M. Ridley, K.E. Thur, Jessica Shanahan, Nagendra Babu Thillaiappan, Ann Shen, Karly Uhl, Charlotte M. Walden, Simon N. Waddington, Frances M. Platt, Aarnoud C. van der Spoel

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development
Mots-clésBiochemistryEnzymeCeramideChemistryEnzyme assay

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

β-Glucosidase 2 (GBA2) is an enzyme that cleaves the membrane lipid glucosylceramide into glucose and ceramide. The GBA2 gene is mutated in genetic neurological diseases (hereditary spastic paraplegia and cerebellar ataxia). Pharmacologically, GBA2 is reversibly inhibited by alkylated imino sugars that are in clinical use or are being developed for this purpose. We have addressed the ambiguity surrounding one of the defining characteristics of GBA2, which is its sensitivity to inhibition by conduritol B epoxide (CBE). We found that CBE inhibited GBA2, in vitro and in live cells, in a time-dependent fashion, which is typical for mechanism-based enzyme inactivators. Compared with the well characterized impact of CBE on the lysosomal glucosylceramide-degrading enzyme (glucocerebrosidase, GBA), CBE inactivated GBA2 less efficiently, due to a lower affinity for this enzyme (higher K I ) and a lower rate of enzyme inactivation ( k inact ). In contrast to CBE, N -butyldeoxygalactonojirimycin exclusively inhibited GBA2. Accordingly, we propose to redefine GBA2 activity as the β-glucosidase that is sensitive to inhibition by N -butyldeoxygalactonojirimycin. Revised as such, GBA2 activity 1) was optimal at pH 5.5–6.0; 2) accounted for a much higher proportion of detergent-independent membrane-associated β-glucosidase activity; 3) was more variable among mouse tissues and neuroblastoma and monocyte cell lines; and 4) was more sensitive to inhibition by N -butyldeoxynojirimycin (miglustat, Zavesca®), in comparison with earlier studies. Our evaluation of GBA2 makes it possible to assess its activity more accurately, which will be helpful in analyzing its physiological roles and involvement in disease and in the pharmacological profiling of monosaccharide mimetics. Background: GBA2 and GBA are both β-glucosidases that degrade glucosylceramide. Results: Conduritol B epoxide inactivates both GBA and GBA2, whereas the imino sugar N B-DGJ selectively inhibits GBA2. Conclusion: N B-DGJ is a suitable reagent to distinguish GBA2 from GBA. Significance: This study redefines GBA2 activity, which is relevant for clinical GBA2 measurements and imino sugar pharmacology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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