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Enregistrement W1972491811 · doi:10.1074/jbc.m109.089078

Studies of the Maltose Transport System Reveal a Mechanism for Coupling ATP Hydrolysis to Substrate Translocation without Direct Recognition of Substrate

2010· article· en· W1972491811 sur OpenAlexafffund
Alister D. Gould, Brian H. Shilton

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesBasic Energy SciencesNational Center for Research ResourcesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchOffice of ScienceNational Institutes of HealthUniversity of SaskatchewanCanadian Light SourceU.S. Department of Energy
Mots-clésMaltoseATP hydrolysisBiochemistryMaltose-binding proteinChemistryMutantConformational changeATPaseSubstrate (aquarium)SucroseBiophysicsBiologyEnzymeRecombinant DNAFusion proteinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ATPase activity of the maltose transporter (MalFGK(2)) is dependent on interactions with the maltose-binding protein (MBP). To determine whether direct interactions between the translocated sugar and MalFGK(2) are important for the regulation of ATP hydrolysis, we used an MBP mutant (sMBP) that is able to bind either maltose or sucrose. We observed that maltose- and sucrose-bound sMBP stimulate equal levels of MalFGK(2) ATPase activity. Therefore, the ATPase activity of MalFGK(2) is coupled to translocation of maltose solely by interactions between MalFGK(2) and MBP. For both maltose and sucrose, the ability of sMBP to stimulate the MalFGK(2) ATPase was greatly reduced compared with wild-type MBP, indicating that the mutations in sMBP have interfered with important interactions between MBP and MalFGK(2). High resolution crystal structure analysis of sMBP shows that in the closed conformation with bound sucrose, three of four mutations are buried, and the fourth causes only a minor change in the accessible surface. In contrast, in the open form of sMBP, all of the mutations are accessible, and the main chain of Tyr(62)-Gly(69) is destabilized and occupies an alternative conformation due to the W62Y mutation. On this basis, the compromised ability of sMBP to stimulate ATP hydrolysis by MalFGK(2) is most likely due to a disruption of interactions between MalFGK(2) and the open, rather than the closed, conformation of sMBP. Modeling the open sMBP structure bound to MalFGK(2) in the transition state for ATP hydrolysis points to an important site of interaction and suggests a mechanism for coupling ATP hydrolysis to substrate translocation that is independent of the exact structure of the substrate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,268

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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