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Enregistrement W1972505402 · doi:10.1111/j.1365-3059.2009.02154.x

Characterization of mutations in the membrane‐anchored subunits AaSDHC and AaSDHD of succinate dehydrogenase from <i>Alternaria alternata</i> isolates conferring field resistance to the fungicide boscalid

2009· article· en· W1972505402 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueFungal Plant Pathogen Control
Établissements canadiensMcGill UniversityBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySDHDAzoxystrobinAlternaria alternataGeneticsBiochemistryGeneMutationFungicideBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular basis of resistance to the fungicide boscalid in 25 Alternaria alternata field mutants exhibiting resistance to boscalid and previously tested negative for AaSDHB mutations conferring boscalid resistance was investigated by cloning and sequencing the A. alternata SDHC ( AaSDHC ) and SDHD ( AaSDHD ) genes from a boscalid‐sensitive isolate. The SDHB and SDHC/SDHD genes encode the iron sulphur and two membrane‐anchored subunits of succinate:ubiquinone oxidoreductase (SQR) that constitute the boscalid fungicide molecular targets. The deduced amino acid sequences exhibited low similarities with SDHC and SDHD peptides from other organisms, but residues essential to form the ubiquinone binding site or important in SQR assembly were particularly conserved. Sequence comparisons of the AaSDHC and AaSDHD genes between resistant mutants and wild‐type isolates revealed that two highly conserved histidine residues implicated in the heme b ligation and located at codon 134 in AaSDHC (22 mutants) and codon 133 in AaSDHD (two mutants) were replaced by arginine residues (H134R and H133R). In another mutant, a substitution of an aspartate by a glutamic acid occurred at amino acid position 123 (D123E) in AaSDHD. Additional tests revealed that mycelial growth of boscalid‐resistant isolates was reduced when isolates were subjected to oxidative stress. The identified mutations were confirmed using PCR‐RFLP assays. This is apparently the first report of mutations located in the heme b ligands of the cytochrome II gene associated with carboxamide resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,277
Score d'incertitude au seuil0,216

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle