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Enregistrement W1972596227 · doi:10.1021/jp801015y

An Ab Initio Quantum Chemical Investigation of <sup>43</sup>Ca NMR Interaction Parameters for the Ca<sup>2+</sup> Sites in Organic Complexes and in Metalloproteins

2008· article· en· W1972596227 sur OpenAlexaff
Alan Wong, Danielle Laurencin, Gang Wu, R. Dupree, Mark E. Smith

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced NMR Techniques and Applications
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research Council
Mots-clésAb initioChemistryChemical shiftComputational chemistryAb initio quantum chemistry methodsPhysical chemistryCrystallographyMoleculeOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have carried out an extensive ab initio quantum chemical (QC)43Ca NMR study on a series of Ca-O organic compounds and three different Ca-bound proteins and found that the HF/6-31G* level of function can reliably predict 43Ca NMR interaction parameters (delta(iso) and chi(q)), especially for organic solids. This QC study finds correlations between Ca-O bond environment (mean distance and coordination number) and delta(iso)(43Ca). Although relatively small values of chi(q)(43Ca) are found for Ca-O organic compounds with a coordination number between 6 and 10, the QC shows that chi(q)(43Ca) is sensitive to the Ca-O coordination geometry of the Ca2+ sites in metalloproteins--a potentially important observation. An application of such ab initio QC 43Ca NMR studies is in characterizing the Ca-O bonding environment around target Ca2+ sites. As an example, we propose a new potential analytical approach using the absolute (43)Ca chemical shielding constant to investigate the hydration shell of Ca2+ in a dilute CaCl2 aqueous solution. Furthermore, by adopting a NMR methodology similar to that reported in Wong et al. Chem. Phys. Lett. 2006, 427, 201, natural abundance 43Ca MAS NMR spectra of Ca(L-glutamate)(2) x 4H2O were recorded, and delta(iso)(43Ca) and the quadrupolar parameter (Pq) were estimated to be 6.6 ppm and 0.8 MHz, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,523

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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