Forced homodimerization of the c-Fos leucine zipper in designed bHLHZ-like hybrid proteins MaxbHLH-Fos and ArntbHLH-Fos
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Although the c-Fos leucine zipper (LZ) does not form a homodimer in its native basic region/leucine zipper (bZIP) structure, we found that it is capable of homodimerization and promoting protein folding in engineered basic region/helix-loop-helix/leucine zipper (bHLHZ) hybrid proteins MaxbHLH-Fos and ArntbHLH-Fos, in which the bHLH subdomains of Max and Arnt are fused to the c-Fos LZ. By using the in vivo yeast one-hybrid system and in vitro circular dichroism and quantitative fluorescence anisotropy, we demonstrated that attachment of the c-Fos LZ to the otherwise unstructured MaxbHLH resulted in a hybrid bHLHZ-like protein now competent for homodimerization and DNA binding at the cognate E-box site, CACGTG. In ArntbHLH-Fos, the c-Fos LZ promoted proper folding of the HLH structure, although unlike MaxbHLH, ArntbHLH alone is capable of homodimerization and DNA binding. In addition, by comparing the E-box binding and secondary structures of MaxbHLH-Fos and two derivatives containing targeted mutations in the c-Fos LZ, we found that cooperative communication exists between the bHLH and LZ: proper folding of the four-helix bundle in the HLH region could be induced by the c-Fos LZ, and the HLH dimerization region could force homodimerization of the c-Fos LZ. These results demonstrate that although intrinsically unfavorable, the c-Fos LZ can homodimerize, demonstrating that the same c-Fos LZ element can yield orthogonal differences in structure and/or DNA-binding function within different transcription factor families, including the bZIP and bHLHZ.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle