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Enregistrement W1972669210 · doi:10.1371/journal.pone.0046768

The Infectious Bursal Disease Virus RNA-Binding VP3 Polypeptide Inhibits PKR-Mediated Apoptosis

2012· article· en· W1972669210 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueVector-Borne Animal Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMinisterio de Economía y Competitividad
Mots-clésProtein kinase RBiologyRNA silencingCapsidInfectious bursal diseaseRNAVirusMolecular biologyVirologyCell biologyEIF-2 kinaseViral replicationProtein kinase APhosphorylationRNA interferenceGeneGeneticsVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infectious bursal disease virus (IBDV) is an avian pathogen responsible for an acute immunosuppressive disease that causes major losses to the poultry industry. Despite having a bipartite dsRNA genome, IBDV, as well as other members of the Birnaviridae family, possesses a single capsid layer formed by trimers of the VP2 capsid protein. The capsid encloses a ribonucleoprotein complex formed by the genome associated to the RNA-dependent RNA polymerase and the RNA-binding polypeptide VP3. A previous report evidenced that expression of the mature VP2 IBDV capsid polypeptide triggers a swift programmed cell death response in a wide variety of cell lines. The mechanism(s) underlying this effect remained unknown. Here, we show that VP2 expression in HeLa cells activates the double-stranded RNA (dsRNA)-dependent protein kinase (PKR), which in turn triggers the phosphorylation of the eukaryotic initiation factor 2α (eIF2α). This results in a strong blockade of protein synthesis and the activation of an apoptotic response which is efficiently blocked by coexpression of a dominant negative PKR polypeptide. Our results demonstrate that coexpression of the VP3 polypeptide precludes phosphorylation of both PKR and eIF2α and the onset of programmed cell death induced by VP2 expression. A mutation blocking the capacity of VP3 to bind dsRNA also abolishes its capacity to prevent PKR activation and apoptosis. Further experiments showed that VP3 functionally replaces the host-range vaccinia virus (VACV) E3 protein, thus allowing the E3 deficient VACV deletion mutant WRΔE3L to grow in non-permissive cell lines. According to results presented here, VP3 can be categorized along with other well characterized proteins such us VACV E3, avian reovirus sigmaA, and influenza virus NS1 as a virus-encoded dsRNA-binding polypeptide with antiapoptotic properties. Our results suggest that VP3 plays a central role in ensuring the viability of the IBDV replication cycle by preventing programmed cell death.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,714
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle