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Enregistrement W1972686511 · doi:10.1016/j.molonc.2007.06.002

Examination of gap junctional, intercellular communication by <i>in situ</i> electroporation on two co‐planar indium‐tin oxide electrodes

2007· article· en· W1972686511 sur OpenAlexafffund
Aikaterini Anagnostopoulou, Jun Cao, Adina Vultur, Kevin Firth, Leda Raptis

Notice bibliographique

RevueMolecular Oncology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Inactivation Methods
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesCancer Research SocietyCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Breast Cancer Research AllianceCongressionally Directed Medical Research ProgramsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaQueen's UniversityU.S. Department of Defense
Mots-clésLucifer yellowElectroporationGap junctionElectrodeMaterials scienceIntracellularIndium tin oxideBiophysicsChemistryCell biologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gap junctions are plasma membrane channels between neighboring cells. We previously described a powerful technique where gap junctional, intercellular communication (GJIC) of adherent cells can be examined by in situ electroporation on a slide, part of which is coated with electrically conductive and transparent indium-tin oxide. An electric pulse is applied through an electrode placed on the cells in the presence of the tracking dye, Lucifer yellow (LY). The pulse causes LY's penetration into the cells growing on the conductive part of the slide, and the subsequent migration of the dye to the non-electroporated cells growing on the non-conductive area is microscopically observed under fluorescence illumination. Although this technique is adequate for a number of cell lines, the turbulence generated as the electrode is removed can cause cell detachment, which makes GJIC examination problematic. In this communication, we describe a slide configuration where junctional communication can be examined in the absence of an upper electrode: Cells are grown on two co-planar electrodes separated by a barrier which diverts the electric field, rendering it vertical to the cell layer. The elimination of an upper electrode is especially valuable for the electroporation of sensitive cells, such as terminally differentiated adipocytes. This technique can also be used for the introduction of other non-permeant molecules such as peptides or siRNA, followed by examination of the cellular phenotype or gene expression levels in situ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,317 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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