Pbx homeodomain proteins direct Myod activity to promote fast-muscle differentiation
Notice bibliographique
Résumé
The basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor Myod directly regulates gene expression throughout the program of skeletal muscle differentiation. It is not known how a Myod-driven myogenic program is modulated to achieve muscle fiber-type-specific gene expression. Pbx homeodomain proteins mark promoters of a subset of Myod target genes, including myogenin (Myog); thus, Pbx proteins might modulate the program of myogenesis driven by Myod. By inhibiting Pbx function in zebrafish embryos, we show that Pbx proteins are required in order for Myod to induce the expression of a subset of muscle genes in the somites. In the absence of Pbx function, expression of myog and of fast-muscle genes is inhibited, whereas slow-muscle gene expression appears normal. By knocking down Pbx or Myod function in combination with another bHLH myogenic factor, Myf5, we show that Pbx is required for Myod to regulate fast-muscle, but not slow-muscle, development. Furthermore, we show that Sonic hedgehog requires Myod in order to induce both fast- and slow-muscle markers but requires Pbx only to induce fast-muscle markers. Our results reveal that Pbx proteins modulate Myod activity to drive fast-muscle gene expression, thus showing that homeodomain proteins can direct bHLH proteins to establish a specific cell-type identity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».