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Enregistrement W1973029265 · doi:10.1074/jbc.m412981200

Chicken Ovalbumin Upstream Promoter-Transcription Factor Members Repress Retinoic Acid-induced Cdx1 Expression

2005· article· en· W1973029265 sur OpenAlexaff
Mélanie Béland, David Lohnes

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOvalbuminTranscription factorRetinoic acidChemistryTranscription (linguistics)Molecular biologyBiologyGeneGeneticsBiochemistryImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It is well established that Hox genes are key players in specifying positional identity along the anterior-posterior axis and are targets of diverse transcription factors implicated in axial patterning. Members of the CDX family (CDX1, -2, and -4) are among such effectors of Hox expression as pertains to vertebral patterning in the mouse. Cdx members are themselves targets of signaling molecules that are also implicated in axial patterning, including retinoic acid (RA) and certain members of Wnt and fibroblast growth factor families. In this regard, we have previously shown that, in the mouse, Cdx1 is directly regulated by RA at the late primitive streak stage (embryonic day (E) 7.5) through a RA response element in the proximal Cdx1 promoter. At E8.5, Cdx1 expression remains essentially limited to the posterior embryo. RA, however, is excluded from the caudal embryo at this later stage, but is found in a more anterior domain encompassing the prospective trunk region. These observations suggest the existence of a repressor mechanism that prevents expression of Cdx1 in these anterior domains of retinoid signaling at E8.5. In the present study, we present evidence suggesting that chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor (COUP-TF) members antagonize RA-induced Cdx1 expression by competing with retinoid X receptor-retinoic acid receptor heterodimers for binding to the Cdx1 RA response element. Consistent with this, in situ hybridization analysis revealed that COUP-TFs are highly expressed in the anterior embryo in domains where Cdx1 transcripts are excluded. Together with other data, these findings suggest a model by which COUP-TF expression is induced by RA in the trunk region as a negative feedback mechanism to restrict Cdx1 expression to the caudal embryo.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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