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Enregistrement W1973071221 · doi:10.1111/j.1365-2672.2009.04366.x

Effect of 2,4-dinitrotoluene on the anaerobic bacterial community in marine sediment

2009· article· en· W1973071221 sur OpenAlexaffabout
Hong Yang, Junlong Zhao, Jalal Hawari

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensBiotechnology Research InstituteNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesOffice of Naval ResearchU.S. Navy
Mots-clésAnaerobic exerciseSedimentMicrobiologyEnvironmental chemistryBiologyEnvironmental scienceEcologyChemistryPhysiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To study the impact of added 2,4-dinitrotoluene (DNT) on the anaerobic bacterial community in marine sediment collected from an unexploded ordnance dumping site in Halifax Harbour. METHODS AND RESULTS: Marine sediment was spiked with 2,4-DNT and incubated under anaerobic conditions in the presence and absence of lactate. Indigenous bacteria in the sediment removed 2,4-DNT with subsequent formation of its mono- and diamino-derivatives under both conditions. PCR-DGGE and nucleotide sequencing were used to monitor the change in the bacterial population in sediment caused by the presence of 2,4-DNT. The results showed that denaturing gradient gel electrophoresis banding patterns of sediment microcosms treated with 2,4-DNT were different from controls that did not receive 2,4-DNT. Bacteroidetes, Firmicutes and delta-Proteobacteria were present in sediment incubated in the absence of 2,4-DNT. However, several gamma-Proteobacteria became dominant in sediment in the presence of 2,4-DNT, two of which were 99% similar to Shewanella canadensis and Shewanella sediminis. In the presence of both 2,4-DNT and lactate, two additional delta-Proteobacteria were enriched, one closely related (98% similarity) to Desulfofrigus fragile and the other affiliated (96% similarity) to Desulfovibrio sp. In contrast, none of the above four Proteobacteria were enriched in sediment incubated with lactate alone. CONCLUSIONS: Presence of 2,4-DNT led to a significant change in bacterial population of marine sediment with the enrichment of several gamma- and delta-Proteobacteria. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: Our results provided the first evidence on the impact of the pollutant 2,4-DNT on the indigenous bacterial community in marine sediment, and provided an insight into the composition of bacterial community that degrade 2,4-DNT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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