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Enregistrement W1973090283 · doi:10.4039/n10-042

Gene characterization of two digestive serine proteases in <i>Sitodiplosis mosellana</i>: implications for alternative control strategies

2010· article· en· W1973090283 sur OpenAlexaff
Lourdes Arrueta, Richard H. Shukle, I.L. Wise, Omprakash Mittapalli

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Entomologist · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesOhio State University
Mots-clésProteasesBiologyMidgutSerineBiochemistryComplementary DNAMolecular biologyGeneEnzymeBotanyLarva

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Two full-length cDNA sequences encoding digestive serine proteases (designated as SmPROT-1 and SmPROT-2 ) were recovered from the midgut of the orange wheat blossom midge, Sitodiplosis mosellana (Géhin) (Diptera: Cecidomyiidae), in an ongoing expressed sequence tag project. The deduced amino acid sequences shared homology with digestive serine proteases from insect and non-insect species, including conserved regions such as the catalytic triad, active pocket, and conserved structural motifs. Secretory signal peptides in both proteases at the N-terminals indicate that these proteins could function as midgut digestive serine proteases. A phylogenetic analysis grouped SmPROT-1 and SmPROT-2 with trypsin-like and chymotrysin-like serine proteases, respectively. Quantitative real-time PCR analysis showed that SmPROT-1 and SmPROT-2 were expressed predominantly in the midgut rather than in other tissues (fat body and salivary glands). Expression analyses revealed high mRNA levels for the feeding instars (1st- and 2nd-instar larvae) compared with other stages (neonate, 3rd instar, pupa, and adult). These results provide new insights into the biology of S. mosellana and are discussed in the context of developing alternative control strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,519
Score d'incertitude au seuil0,980

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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