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Enregistrement W1973135352 · doi:10.1371/journal.pone.0113642

The Proapoptotic Protein BNIP3 Interacts with VDAC to Induce Mitochondrial Release of Endonuclease G

2014· article· en· W1973135352 sur OpenAlexafffund
Xiaosha Zhang, Jiming Kong

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChina Scholarship CouncilCanadian Stroke NetworkManitoba Health Research Council
Mots-clésVoltage-dependent anion channelMitochondrionCell biologyImmunoprecipitationMitochondrial permeability transition poreCytosolMitochondrial membrane transport proteinBiologyChemistryMolecular biologyProgrammed cell deathApoptosisBiochemistryBacterial outer membraneInner mitochondrial membraneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BNIP3 is a proapoptotic protein that induces cell death through a mitochondria-mediated pathway. We reported previously that mitochondrial localization of BNIP3 and translocation of EndoG from mitochondria to the nucleus are critical steps of the BNIP3 pathway. It is not clear, however, that how BNIP3 interacts with mitochondria. Here we show that expression of BNIP3 resulted in mitochondrial release and nuclear translocation of EndoG. Incubation of a recombinant GST-BNIP3 protein with freshly isolated mitochondria led to the integration of BNIP3 into mitochondria, reduction in the levels of EndoG in mitochondria and the presence of EndoG in the supernatant that was able to cleave chromatin DNA. Co-immunoprecipitation and mass spectrometry analysis reveals that BNIP3 interacted with the voltage-dependent anion channel (VDAC) to increase opening probabilities of mitochondrial permeability transition (PT) pores and induce mitochondrial release of EndoG. Blocking VDAC with a VDAC antibody largely abolished mitochondrial localization of BNIP3 and prevented EndoG release. Together, the data identify VDAC as an interacting partner of BNIP3 and support endonuclease G as a mediator of the BNIP3 pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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