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Enregistrement W1973137043 · doi:10.1128/aac.45.5.1337-1342.2001

Synergy of Histone-Derived Peptides of Coho Salmon with Lysozyme and Flounder Pleurocidin

2001· article· en· W1973137043 sur OpenAlexaff
Aleksander Patrzykat, Lijuan Zhang, Valentina Mendoza, George K. Iwama, Robert E. W. Hancock

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLysozymeVibrio anguillarumAntimicrobial peptidesAeromonas salmonicidaBiochemistryAntimicrobialBiologyMucusMicrobiologyPeptideFlounderPeptide sequenceOlive flounderVibrioBacteriaFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent research has identified endogenous cationic antimicrobial peptides as important factors in the innate immunity of many organisms, including fish. It is known that antimicrobial activity, as well as lysozyme activity, can be induced in coho salmon (Oncorhynchus kisutch) mucus after exposure of the fish to infectious agents. Since lysozyme alone does not have antimicrobial activity against Vibrio anguillarum and Aeromonas salmonicida, a four-step protein purification protocol was used to isolate and identify antibacterial fractions from bacterially challenged coho salmon mucus and blood. The purification consisted of extraction with hot acetic acid, extraction and concentration on a C(18) cartridge, gel filtration, and reverse-phase chromatography on a C(18) column. N-terminal amino acid sequence analyses revealed that both the blood and the mucus antimicrobial fractions demonstrated identity with the N terminus of trout H1 histone. Mass spectroscopic analysis indicated the presence of the entire histone, as well as fragments thereof, including a 26-amino-acid N-terminal segment. These fractions inhibited the growth of antibiotic-supersuscptible Salmonella enterica serovar Typhimurium, as well as A. salmonicida and V. anguillarum. Synthetic peptides identical to the N-terminally acetylated or C-terminally amidated 26-amino-acid fragment were inactive in antimicrobial assays, but they potentiated the antimicrobial activities of the flounder peptide pleurocidin, lysozyme, and crude lysozyme-containing extracts from coho salmon. The peptides bound specifically to anionic lipid monolayers. However, synergy with pleurocidin did not appear to occur at the cell membrane level. The synergistic activities of inducible histone peptides indicate that they play an important role in the first line of salmon defenses against infectious pathogens and that while some histone fragments may have direct antimicrobial effects, others improve existing defenses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,809

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations127
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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