Structural features and functional domains of amassin-1, a cell-binding olfactomedin protein
Notice bibliographique
Résumé
Amassin-1 mediates a rapid cell adhesion that tightly adheres sea urchin coelomocytes (body cavity immunocytes) together. Three major structural regions exist in amassin-1: a short beta region, 3 coiled coils, and an olfactomedin domain. Amassin-1 contains 8 disulfide-bonded cysteines that, upon reduction, render it inactive. Truncated forms of recombinant amassin-1 were expressed and purified from Pichia pastoris and their disulfide bonding and biological activities investigated. Expressed alone, the olfactomedin domain contained 2 intramolecular disulfide bonds, existed in a monomeric state, and inhibited amassin-1-mediated clotting of coelomocytes by a calcium-dependent cell-binding activity. The N-terminal beta region, containing 3 cysteines, was not required for clotting activity. The coiled coils may dimerize amassin-1 in a parallel orientation through a homodimerizing disulfide bond. Neither amassin-1 fragments that were disulfide-linked as dimers or that were engineered to exist as dimers induced coelomocytes clotting. Clotting required higher multimeric states of amassin-1, possibly tetramers, which occurred through the N-terminal beta region and (or) the first segment of coiled coils.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».