Spectrum of SPG4 Mutations in a Large Collection of North American Families With Hereditary Spastic Paraplegia
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Hereditary spastic paraplegia (HSP) is a neurodegenerative disease characterized by progressive spasticity and weakness of the lower limbs. The most common form of HSP is caused by mutations in the SPG4 gene, which codes for spastin, an adenosine triphosphatase with various cellular activities (AAA) protein family member. OBJECTIVE: To investigate a large collection of predominantly North American patients with HSP for mutations in the spastin encoding gene, SPG4. METHODS: DNA from 76 unrelated affected individuals was studied for mutations by single-stranded conformational polymorphism analysis and direct sequencing. Each new variant identified was then analyzed in 80 control subjects to determine whether the variant is a common polymorphism or a rare mutation. All DNA samples were amplified by polymerase chain reaction, followed by electrophoresis and autoradiography. RESULTS: We identified 8 novel mutations and 5 previously reported mutations in 15 affected individuals. The novel mutations are 4 missense, 1 nonsense, 1 frameshift, and 2 splice mutations. Two polymorphisms (one in an affected individual) were also identified. CONCLUSIONS: Our collection of families with HSP is different on a genetic level from those previously described. The percentage of our families with a SPG4 mutation is 10% lower than the 40% estimate of families with autosomal dominant HSP noted to be linked to this locus, and splice mutations are not predominant in our collection. Interestingly, we also identified 2 recurring mutations in specific populations (R562Q and G559D), which may facilitate the development of future spastin diagnostic testing in these populations.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle