Frequency of the <i>TMPRSS2:ERG</i> gene fusion is increased in moderate to poorly differentiated prostate cancers
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Recent reports indicate that prostate cancers (CaP) frequently over-express the potential oncogenes, ERG or ETV1. Many cases have chromosomal rearrangements leading to the fusion of the 5' end of the androgen-regulated serine protease TMPRSS2 (21q22.2) to the 3' end of either ERG (21q22.3) or ETV1 (7p21.3). The consequence of these rearrangements is aberrant androgen receptor-driven expression of the potential oncogenes, ETV1 or ERG. AIM: To determine the frequency of rearrangements involving TMPRSS2, ERG, or ETV1 genes in CaP of varying Gleason grades through fluorescence in situ hybridisation (FISH) on CaP tissue microarrays (TMAs). METHODS: Two independent assays, a TMPRSS2 break-apart assay and a three-colour gene fusion FISH assay were applied to TMAs. FISH positive cases were confirmed by reverse transcriptase (RT) PCR and DNA sequence analysis. RESULTS: A total of 106/196 (54.1%) cases were analysed by FISH. None of the five benign prostatic hyperplasia cases analysed exhibited these gene rearrangements. TMPRSS2:ERG fusion was found more frequently in moderate to poorly differentiated tumours (35/86, 40.7%) than in well differentiated tumours (1/15, 6.7%, p = 0.017). TMPRSS2:ETV1 gene fusions were not detected in any of the cases tested. TMPRSS2:ERG fusion product was verified by RT-PCR followed by DNA sequencing in 7/7 randomly selected positive cases analysed. CONCLUSION: This study indicates that TMPRSS2:ERG gene rearrangements in CaP may be used as a diagnostic tool to identify prognostically relevant sub-classifications of these cancers.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».