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Enregistrement W1973401123 · doi:10.1111/j.1600-0587.2009.05774.x

Islands in the ice: colonisation routes for rock ptarmigan to the Svalbard archipelago

2009· article· en· W1973401123 sur OpenAlexaboutno aff
Tobias Sahlman, Gernot Segelbacher, ‎Jacob Höglund

Notice bibliographique

RevueEcography · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColonisationBeringiaTundraArcticArchipelagoPopulationEcologyBiologyRefugium (fishkeeping)mtDNA control regionGeographyZoologyHabitatHaplotypeColonizationAlleleDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ancestors of rock ptarmigan Lagopus muta originated in the Beringia area well before the disruption of the Beringian land bridge. They spread westwards to Siberia and eastwards to the North American arctic and Greenland. The distribution of rock ptarmigan has been affected by glaciations restricting it to geographically limited refugia. Today the species has a circumpolar distribution in arctic tundra and alpine habitats, with up to 30 subspecies recognised based on morphological characters. We sequenced the mitochondrial control region for 72 individuals and genotyped 69 individuals for 12 microsatellite loci to investigate neutral genetic variation within and among five rock ptarmigan populations, Greenland, Iceland, Scandinavia, Svalbard and Taimyr. Genetic structure among the studied samples was high, overall F ST estimated from microsatellite loci was 0.18 and only one out of 16 mtDNA haplotypes was found in more than one population. Genetic variation ( h, π, H e , allelic richness) was slightly lower in the Svalbard population than in other populations, suggesting a low effective population size, possibly due to isolation following colonisation. An unrooted network and a phylogenetic tree showed that the Scandinavian population has diverged from the other populations by at least ten mutational steps, probably due to independent colonisation of Europe and subsequent long‐term isolation, and rules out Scandinavia as a source for colonisation of Svalbard. Alignment with partial control region sequences from other studies showed that the haplotype that was central in our network and found on Svalbard and in Taimyr, most likely corresponds to a haplotype found in Siberia, Alaska and the Canadian Arctic, but not in Greenland, Scandinavia and Iceland. This suggests an eastern origin of rock ptarmigan in Svalbard, although this question cannot be settled conclusively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,242
Score d'incertitude au seuil0,190

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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