Phylogenetic analysis of house dust mites
Notice bibliographique
Résumé
Abstract House dust mites live in house dusts and affect the health of humans. Among the many species, Dermatophagoides farinae, D. pteronyssinus, and Euroglyphus maynei have been found to be commonly associated with Ig-E-mediated allergic diseases. As a result, there is increasing effort to develop methods for the diagnosis and treatment of diseases caused by these species. The purpose of the current study was to explore the evolutionary relationships among house dust mites. After adult D. farinae were separated and isolated for total RNA extract, the cDNA coding for Der f 1 and Der f 2 were cloned and sequenced. Then amino acid sequences for group 1 and 2 allergens of two of the most common house dust mites, D. pteronyssinus, E. maynei, were obtained from databases. Interestingly, homological analysis of amino acid sequences showed that both Der p 1 and Der p 2 from D. pteronyssinus had more similarities to Eur m 1 and Eur m 2, respectively, than they had to Der f 1 and Der f 2 from D. farinae. In the phylogenetic trees, D. pteronyssinus clustered with E. maynei, but not with D. farinae, although D. pteronyssinus and D. farinae belong to the same genus according to morphological taxonomy. It was previously assumed that D. pteronyssinus was more similar to E. maynei than to D. farinae at evolutionary levels.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».