Determinants of RasC Specificity during Dictyostelium Aggregation
Notice bibliographique
Résumé
RasC is required for optimum activation of adenylyl cyclase A and for aggregate stream formation during the early differentiation of Dictyostelium discoideum. RasG is unable to substitute for this requirement despite its sequence similarity to RasC. A critical question is which amino acids in RasC are required for its specific function. Each of the amino acids within the switch 1 and 2 domains in the N-terminal portion of RasG was changed to the corresponding amino acid from RasC, and the ability of the mutated RasG protein to reverse the phenotype of rasC(-) cells was determined. Only the change from aspartate at position 30 of RasG to alanine (the equivalent position 31 in RasC) resulted in a significant increase in adenylyl cyclase A activation and a partial reversal of the aggregation-deficient phenotype of rasC(-) cells. All other single amino acid changes were without effect. Expression of a chimeric protein, RasG(1-77)-RasC(79-189), also resulted in a partial reversal of the rasC(-) cell phenotype, indicating the importance of the C-terminal portion of RasC. Furthermore, expression of the chimeric protein, with alanine changed to aspartate (RasG(1-77(D30A))-RasC(79-189)), resulted in a full rescue the rasC(-) aggregation-deficient phenotype. Finally, the expression of either a mutated RasC, with the aspartate 31 replaced by alanine, or the chimeric protein, RasC(1-78)-RasG(78-189), only generated a partial rescue. These results emphasize the importance of both the single amino acid at position 31 and the C-terminal sequence for the specific function of RasC during Dictyostelium aggregation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».