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Enregistrement W1973582687 · doi:10.1021/jo0160773

Tandem Oligonucleotide Synthesis on Solid-Phase Supports for the Production of Multiple Oligonucleotides

2002· article· en· W1973582687 sur OpenAlexaff
Richard T. Pon, Shuyuan Yu, Yogesh S. Sanghvi

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Organic Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOligonucleotideLinkerChemistryOligonucleotide synthesisTandemSolid-phase synthesisCombinatorial chemistryCleavage (geology)DNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

More than one oligonucleotide can be synthesized at a time by linking multiple oligonucleotides end-to-end in a tandem manner on the surface of a solid-phase support. The 5'-terminal hydroxyl position of one oligonucleotide serves as the starting point for the next oligonucleotide synthesis. The two oligonucleotides are linked via a cleavable 3'-O-hydroquinone-O,O'-diacetic acid linker arm (Q-linker). The Q-linker is rapidly and efficiently coupled to the 5'-OH position of immobilized oligonucleotides using HATU, HBTU, or HCTU in the presence of 1 equiv of DMAP. This protocol avoids introduction of phosphate linkages on either the 3'- or 5'-end of oligonucleotides. A single NH(4)OH cleavage step can simultaneously release the products from the surface of the support and each other to produce free 5'- and 3'-hydroxyl termini. Selective cleavage of one oligonucleotide out of two sequences has also been accomplished via a combination of succinyl and Q-linker linker arms. Tandem synthesis of multiple oligonucleotides is useful for producing sets of primers for PCR, DNA sequencing, and other diagnostic applications as well as double-stranded oligonucleotides. Tandem synthesis of the same sequence multiple times increases the yield of material from any single synthesis column for maximum economy in large-scale synthesis. This method can also be combined with reusable solid-phase supports to further reduce the cost of oligonucleotide production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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