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Enregistrement W1973604751 · doi:10.1074/jbc.m801058200

Modulation of the Regulatory Activity of Bacterial Two-component Systems by SlyA

2008· article· en· W1973604751 sur OpenAlexaff
Haowei Song, Wei Kong, Natasha Weatherspoon, Guozheng Qin, William J. Tyler, John Turk, Roy Curtiss, Yixin Shi

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesArizona State University
Mots-clésRegulonResponse regulatorTwo-component regulatory systemOperonBacterial transcriptionPsychological repressionTranscription factorTranscription (linguistics)Cell biologySignal transductionBiologyTranscriptional regulationRepressorRegulatorGeneGeneticsPromoterGene expressionMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Activation of the transcriptional regulator SlyA by the PhoP/PhoQ two-component system controls intracellular expression of numerous factors influencing Salmonella virulence. By dissecting the SlyA regulon using stable isotope labeling with amino acids in cell culture analysis, we found that SlyA enhances overall transcription of PhoP-activated loci. This amplification of cellular responses to Mg2+ occurs when SlyA binds to the phoPQ promoter thereby activating phoP autoregulation via a positive feedback mechanism. SlyA footprints a DNA region located one helical turn upstream of the PhoP box, which overlaps the H-NS-binding motif required for signal-dependent phoP repression in high Mg2+ conditions. Therefore, binding of SlyA likely antagonizes H-NS and facilitates the interaction of PhoP to its own promoter, subsequently activating the phoPQ operon. Establishment of this regulatory circuit allows SlyA to exert its effect on the PhoP/PhoQ system specifically in Salmonella, which may confer an additional transcriptional regulation. Thus, our results provide a molecular mechanism that determines SlyA-dependent activation of PhoP-regulated genes in modulating Salmonella virulence. Evidence from this study also suggests a function of SlyA as a mediator in signal transduction from the PhoP/PhoQ system to other bacterial two-component systems in Salmonella.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,299

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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