An integrated physical, genetic and cytogenetic map around the<i>sunn</i>locus of<i>Medicago truncatula</i>
Notice bibliographique
Résumé
The sunn mutation of Medicago truncatula is a single-gene mutation that confers a novel supernodulation phenotype in response to inoculation with Sinorhizobium meliloti. We took advantage of the publicly available codominant PCR markers, the high-density genetic map, and a linked cytogenetic map to define the physical and genetic region containing sunn. We determined that sunn is located at the bottom of linkage group 4, where a fine-structure genetic map was used to place the locus within a approximately 400-kb contig of bacterial artificial chromosome (BAC) clones. Genetic analyses of the sunn contig, as well as of a second, closely linked BAC contig designated NUM1, indicate that the physical to genetic distance within this chromosome region is in the range of 1000 -1100 kb.cM-1. The ratio of genetic to cytogenetic distance determined across the entire region is 0.3 cM.microm(-1). These estimates are in good agreement with the empirically determined value of approximately 300 kb.microm(-1) measured for the NUM1 contig. The assignment of sunn to a defined physical interval should provide a basis for sequencing and ultimately cloning the responsible gene.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».