Temperature-sensitive Post-translational Regulation of Plant Omega-3 Fatty-acid Desaturases Is Mediated by the Endoplasmic Reticulum-associated Degradation Pathway
Notice bibliographique
Résumé
Changes in ambient temperature represent a major physiological challenge to membranes of poikilothermic organisms. In plants, the endoplasmic reticulum (ER)-localized omega-3 fatty-acid desaturases (Fad3) increase the production of polyunsaturated fatty acids at cooler temperatures, but the FAD3 genes themselves are typically not up-regulated during this adaptive response. Here, we expressed two closely related plant FAD3 genes in yeast cells and found that their enzymes produced significantly different amounts of omega-3 fatty acids and that these differences correlated to differences in rates of protein turnover. Domain-swapping and mutagenesis experiments revealed that each protein contained a degradation signal in its N terminus and that the charge density of a PEST-like sequence within this region was largely responsible for the differences in rates of protein turnover. The half-life of each Fad3 protein was increased at cooler temperatures, and protein degradation required specific components of the ER-associated degradation pathway including the Cdc48 adaptor proteins Doa1, Shp1, and Ufd2. Expression of the Fad3 proteins in tobacco cells incubated with the proteasomal inhibitor MG132 further confirmed that they were degraded via the proteasomal pathway in plants. Collectively, these findings indicate that Fad3 protein abundance is regulated by a combination of cis-acting degradation signals and the ubiquitin-proteasome pathway and that modulation of Fad3 protein amounts in response to temperature may represent one mechanism of homeoviscous adaptation in plants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».