Cation-Induced Stabilization of Protein Complexes in the Gas Phase: Mechanistic Insights From Hemoglobin Dissociation Studies
Notice bibliographique
Résumé
Collision-induced dissociation (CID) of electrosprayed protein complexes usually involves asymmetric charge partitioning, where a single unfolded chain gets ejected that carries a disproportionately large fraction of charge. Using hemoglobin (Hb) tetramers as model system, we confirm earlier reports that bound metal ions can stabilize protein complexes under CID conditions. We examine the mechanism underlying this effect. Nonvolatile salts cause extensive adduct formation. Significant stabilization was observed for Mg(2+) and Ca(2+), whereas K(+), Rb(+), and Cs(+) had no effect. Precursor ion selection was used to examine Hb subpopulations with well-defined metal binding levels. K(+), Rb(+), and Cs(+)-adducted tetramers eject monomers that carry roughly one-quarter of the metal ions that were bound to the precursor. This demonstrates that charge migration during CID is exclusively due to proton transfer, not metal ion transfer. Also, replacement of highly mobile charge carriers (protons) with less mobile species (metal ions) does not exert a stabilizing influence under the conditions used here. Interestingly, Hb carrying stabilizing ions (Mg(2+) and Ca(2+)) generates monomeric CID products that are metal depleted. This effect is attributed to a combination of two factors: (1) Me(2+) binding stabilizes Hb via formation of chelation bridges (e.g., R-COO(-) Me(2+) (-)OOC-R); the more Me(2+) a subunit contains the more stable it is. (2) More than ~90% of the tetramers contain at least one subunit with a below-average number of Me(2+). The prevalence of monomeric CID products with depleted Me(2+) levels is caused by the tendency of these low metal-containing subunits to undergo preferential unfolding/ejection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».