Quantitative <sup>13</sup>C and <sup>2</sup>H NMR Relaxation Studies of the 723-Residue Enzyme Malate Synthase G Reveal a Dynamic Binding Interface
Notice bibliographique
Résumé
A detailed understanding of molecular recognition is predicated not only on high-resolution static structures of the free and bound states but also on information about how these structures change with time, that is, molecular dynamics. Here we present a deuterium ((2)H) and carbon ((13)C) NMR relaxation study of methyl side chain dynamics in the 82 kDa enzyme malate synthase G (MSG) that is a promising target for the development of new antibiotic agents. It is shown that excellent agreement between (2)H- and (13)C-derived measures of dynamics is obtained, with correlation coefficients exceeding 0.95. The binding interface formed by MSG and its substrates is found to be highly dynamic in the ligand-free state of the enzyme with rigidification upon binding substrate. This study establishes that detailed, quantitative information about methyl side chain dynamics can be obtained by NMR on proteins with molecular masses on the order of 100 kDa and opens up the possibilities for studies of motion in a large number of important systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».