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Enregistrement W1974159945 · doi:10.1118/1.4735059

SU‐E‐T‐05: Comparing DNA Strand Break Yields for Photons under Different Irradiation Conditions with Geant4‐DNA

2012· article· en· W1974159945 sur OpenAlexaff
Piotr Pater, Mario A. Bernal, Jan Seuntjens

Notice bibliographique

RevueMedical Physics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCutoffPhotonDNAPhysicsElectronLinear energy transferIsotropyRelative biological effectivenessIrradiationSecondary electronsAtomic physicsMolecular physicsOpticsNuclear physicsBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To validate and scrutinize published DNA strand break data with Geant4-DNA and a probabilistic model. To study the impact of source size, electronic equilibrium and secondary electron tracking cutoff on direct relative biological effectiveness (DRBE). METHODS: density. The ROI was irradiated with mono-energetic photons, with a uniformly distributed volumetric isotropic source (0.28, 1.5 keV) or a plane beam (0.662, 1.25 MeV), of variable size. Electrons were tracked down to 50 or 10 eV, with G4-DNA processes and energy transfer greater than 10.79 eV was scored. Based on volume ratios, each scored event had a 0.0388 probability of happening on either DNA helix (break). Clusters of at least one break on each DNA helix within 3.4 nm were found using a DBSCAN algorithm and categorized as double strand breaks (DSB). All other events were categorized as single strand breaks (SSB). RESULTS: Geant4-DNA is able to reproduce strand break yields previously published. Homogeneous irradiation conditions should be present throughout the ROI for DRBE comparisons. SSB yields seem slightly dependent on the primary photon energy. DRBEs show a significant increasing trend for lower energy incident photons. A lower electron cutoff produces higher SSB yields, but decreases the SSB/DSB yields ratio. The probabilistic and geometrical DNA models can predict equivalent results. CONCLUSIONS: Using Geant4, we were able to reproduce previously published results on the direct strand break yields of photon and study the importance of irradiation conditions. We also show an ascending trend for DRBE with lower incident photon energies. A probabilistic model coupled with track structure analysis can be used to simulate strand break yields. NSERC, CIHR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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Résumé présentoui

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