MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1974182176 · doi:10.1002/cyto.b.20151

Diagnosing PNH with FLAER and multiparameter flow cytometry

2007· article· en· W1974182176 sur OpenAlexaff
D. Robert Sutherland, Nancy Kuek, J. A. Davidson, David Barth, Hong Chang, Erik Yeo, Sylvia Bamford, Ian Chin‐Yee, Michael Keeney

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutoimmune and Inflammatory Disorders Research
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlow cytometryCD59ImmunologyParoxysmal nocturnal hemoglobinuriaBiologyCell biologyAntibodyComplement system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: PNH is an acquired hematopoietic stem cell disorder leading to a partial or absolute deficiency of all glycophosphatidyl-inositol (GPI)-linked proteins. The classical approach to diagnosis of PNH by cytometry involves the loss of at least two GPI-linked antigens on RBCs and neutrophils. While flow assays are more sensitive and specific than complement-mediated lysis or the Hams test, they suffer from several drawbacks. Bacterial aerolysin binds to the GPI moiety of cell surface GPI-linked molecules and causes lysis of normal but not GPI-deficient PNH cells. FLAER is an Alexa488-labeled inactive variant of aerolysin that does not cause lysis of cells. Our goals were to develop a FLAER-based assay to diagnose and monitor patients with PNH and to improve detection of minor populations of PNH clones in other hematologic disorders. METHODS: In a single tube assay, we combined FLAER with CD45, CD33, and CD14 allowing the simultaneous analysis of FLAER and the GPI-linked CD14 structure on neutrophil and monocyte lineages. RESULTS: Comparison to standard CD55 and CD59 analysis showed excellent agreement. Because of the higher signal to noise ratio, the method shows increased sensitivity in our hands over single (CD55 or CD59) parameter analysis. Using this assay, we were able to detect as few as 1% PNH monocytes and neutrophils in aplastic anemia, that were otherwise undetectable using CD55 and CD59 on RBC's. We also observed abnormal FLAER staining of blast populations in acute leukemia. In these cases, the neutrophils stained normally with FLAER, while the gated CD33bright cells failed to express normal levels of CD14 and additionally showed aberrant CD45 staining and bound lower levels of FLAER. CONCLUSION: FLAER combined with multiparameter flow cytometry offers an improved assay for diagnosis and monitoring of PNH clones and may have utility in detection of unsuspected myeloproliferative disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0040,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations104
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCytometry Part B Clinical CytometryMême sujetAutoimmune and Inflammatory Disorders ResearchTravaux en français237 207