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Enregistrement W1974197507 · doi:10.1242/jcs.064071

Dynamic, inter-subunit interactions between the N-terminal and central mutation regions of cardiac ryanodine receptor

2010· article· en· W1974197507 sur OpenAlexafffund
Zheng Liu, Ruiwu Wang, Xixi Tian, Xiaowei Zhong, Jaya Gangopadhyay, Richard W. Cole, Noriaki Ikemoto, S. R. Wayne Chen, Terence Wagenknecht

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFörster resonance energy transferRyanodine receptor 2Ryanodine receptorYellow fluorescent proteinBiologyHEK 293 cellsProtein subunitBiophysicsCell biologyTransfectionMolecular biologyBiochemistryReceptorFluorescenceEndoplasmic reticulumGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Naturally occurring mutations in the cardiac ryanodine receptor (RyR2) have been linked to certain types of cardiac arrhythmias and sudden death. Two mutation hotspots that lie in the N-terminal and central regions of RyR2 are predicted to interact with one another and to form an important channel regulator switch. To monitor the conformational dynamics involving these regions, we generated a fluorescence resonance energy transfer (FRET) pair. A yellow fluorescent protein (YFP) was inserted into RyR2 after residue Ser437 in the N-terminal region, and a cyan fluorescent protein (CFP) was inserted after residue Ser2367 in the central region, to form a dual YFP- and CFP-labeled RyR2 (RyR2(S437-YFP/S2367-CFP)). We transfected HEK293 cells with RyR2(S437-YFP/S2367-CFP) cDNAs, and then examined them by using confocal microscopy and by measuring the FRET signal in live cells. The FRET signals are influenced by modulators of RyR2, by domain peptides that mimic the effects of disease causing RyR2 mutations, and by various drugs. Importantly, FRET signals were also readily detected in cells co-transfected with single CFP (RyR2(S437-YFP)) and single YFP (RyR2(S2367-CFP)) labeled RyR2, indicating that the interaction between the N-terminal and central mutation regions is an inter-subunit interaction. Our studies demonstrate that FRET analyses of this CFP- and YFP-labeled RyR2 can be used not only for investigating the conformational dynamics associated with RyR2 channel gating, but potentially, also for identifying drugs that are capable of stabilizing the conformations of RyR2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,596
Score d'incertitude au seuil0,225

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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