Structuration of the genetic and metabolite diversity among Prince Edward Island cultivated wild rose ecotypes
Notice bibliographique
Résumé
Wild roses are widespread throughout North America but it is only recently that commercial interests have increased worldwide for rosehip products. Rosehip production under field conditions is new for North American wild roses and the cultivated materials are not well characterized. Despite recent phylogenetic studies on North American roses, micro-evolutionary studies at regional level in terms of genetic and metabolite diversity are scarce. We have characterized 30 wild rose ecotypes collected from different regions Prince Edward Island using microsatellite (SSR) markers, SNP of the chloroplast trna L intron and the nuclear gene GAPDH , ploidy determination as well as the metabolite profiling for major phenolics and fatty acids. A total of 244 SSR alleles, with an average of 12.2 per marker were observed. The polymorphic information content (PIC) ranged between 0.00 and 0.97, with an average of 0.70. Cluster analysis showed three main clusters, cluster 3 showing the greatest diversity. Within each cluster, the ecotypes also showed large metabolite diversity, reflective of their genetic diversity. The data suggests the potential for the cultivation of a given ecotype for its unique metabolite profile or it incorporation in breeding programs. The ploidy and phylogenetic studies showed that all 30 ecotypes were tetraploid and that the collection is consisted of Rosa virginiana and its natural hybrids with Rosa carolina .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».