Involvement of zinc in the binding ofMycoplasma arthritidis-derived mitogen to the proximity of the HLA-DR binding groove regardless of histidine 81 of the β chain
Notice bibliographique
Résumé
Although our recent studies have provided the first evidence demonstrating the direct binding of Mycoplasma arthritidis-derived mitogen (MAM) to MHC class II molecules, it is not yet established how MAM interacts with these molecules. Herein, we demonstrate that MAM binds preferentially and with high affinity to HLA-DR molecules in a zinc-dependent manner. MAM's affinity (25 nM) for HLA-DR molecules is comparable to that of staphylococcal superantigens, and is slightly higher than that for murine MHC class II molecules expressed on the A20 B cell line (111 nM). The amino acid residues located between 14 - 31 and 76 - 90 of the MAM N-terminus play a critical role in MAM / HLA-DR interactions. Histidine at position 81 of the HLA-DR beta-chain, known to be critical for binding of zinc-coordinated superantigens, is not necessary for MAM / HLA-DR interactions. The HLA-DR residues involved in MAM binding are located in the proximal binding groove of the HLA-DR molecule, where the nature of the peptide of the binding groove plays an important role in MAM / HLA-DR interaction. This is the first detailed characterization of MAM's interactions with MHC class II molecules showing a mode of interaction with HLA-DR distinct from that of other superantigens.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».