Characterization of the Pentacoordinate Sodium Cations in Hydrated Nucleoside 5‘-Phosphates by Solid-State <sup>23</sup>Na NMR and Quantum Mechanical Calculations
Notice bibliographique
Résumé
We report a solid-state 23 Na NMR study for the sodium cations in four hydrated disodium salts of nucleoside 5‘-phosphates: 2‘-deoxycytidine 5‘-monophosphate (dCMP), 2‘-deoxyguanosine 5‘-monophosphate (dGMP), 2‘-deoxyuridine 5‘-monophosphate (dUMP), and adenosine 5‘-triphosphate (ATP). Using one- and two-dimensional solid-state NMR techniques, we were able to detect all crystallographically distinct Na + ions in each of the Na−nucleotide systems. A total of 12 Na sites were fully characterized, among which four exhibit unusual penta-coordination geometry. The present study provides the first reliable solid-state 23 Na NMR characterization for the pentacoordinate Na + ions in nucleoside 5‘-phosphates. Spectral assignment was achieved on the basis of quantum mechanical electric-field-gradient (EFG) calculations at the restricted Hartree−Fock level with a 6-31G(d) basis set. The pentacoordinate Na + ion found in [d(TG 4 T)] 4 by high-resolution X-ray crystallography was modeled by using an isolated guanine quartet together with a central Na + ion and an axial water molecule. Quantum mechanical calculations suggest that the 23 Na quadrupole coupling constant for this square-pyramidal Na site is large (ca. 3 MHz), providing a possible explanation for the previous failure in detecting this type of Na + ions by solid-state 23 Na NMR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».