Chromatographic method for quick estimation of DNA interaction potency of environmental pollutants
Notice bibliographique
Résumé
The DNA interaction potency of a chemical has been defined in the present study as the degree of a chemical's ability to interact with DNA. An estimation method of such a potency has been established based on the peak reduction of an oligonucleotide probe resulting from its interaction with chemicals based on high-performance liquid chromatography. A DNA interaction potency equivalency (PEQ) also has been proposed to evaluate the relative interaction potency of test chemicals against benzo[a]pyrene-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide (BPDE). Five known direct DNA interaction chemicals were employed to demonstrate the method. Two known inactive chemicals were used as negative controls. Both the potency and PEQ(50) values (PEQ of testing chemical at 50% of the probe peak reduction) of these five chemicals were determined as BPDE > phenyl glycidyl ether (PGE) > tetrachlorohydroquinone (Cl4HQ) > methyl methanesulfonate (MMS) > styrene-7,8-oxide (SO). Among the reactive chemicals, MMS was found to break the oligonucleotide into smaller fragments, whereas BPDE, PGE, and SO form covalent adducts with the oligonucleotide. In the latter case, the formation of multi-chemical-oligonucleotide adducts also was observed by mass spectrometry. The method was employed to estimate the DNA interaction potency equivalency of diesel vehicle exhaust gas to demonstrate the applicability of this approach in evaluating the interaction potency of environmental pollutants in both gas and liquid phases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».