Abstract 1330: Divergent Control of the Mitochondrial Death Gene BNIP3 by Opposing Actions of the Cellular Factors Nuclear Factor kappaB and E2F-1 in Ventricular Myocytes.
Notice bibliographique
Résumé
The hypoxia-inducible death factor Bnip3 is known to provoke mitochondrial perturbations and cell death of ventricular myocytes. The transcriptional control processes that govern Bnip3 gene expression under basal and inducible conditions remain cryptic. Sequence analysis of the Bnip3 promoter revealed the presence of distinct but overlapping DNA binding elements for the cell cycle factor E2F-1 and cellular factor NF-κB. Previously, we reported a survival role for NF-κB in ventricular myocytes. As a step toward elucidating the regulation of Bnip3 gene expression in ventricular myocytes, we tested the impact of E2F-1 and NF-κB on basal and inducible expression of Bnip3. A 2.0 fold increase in Bnip3 gene transcription was observed in cells expression wild type E2F-1 but not in cells expressing an E2F-1 mutant defective for DNA binding. Interestingly, basal Bnip3 gene transcription was increased by 2.5 fold in myocytes rendered defective for NF-κB activation with a non-phosphorylatable form of IκBα. Importantly, genetic ablation of E2F-1 inhibited basal and inducible Bnip3 transcription in NF-κB defective cells. Expression of the p65 subunit of NF-κB in NF-κB defective cells inhibited E2F-1 mediated Bnip3 transcription. Western blot analysis of cardiac cell lysate revealed that p65 NF-κB immunoprecipitated with E2F-1. ChIP analysis of the Bnip3 promoter indicated that the p65 NF-κB bound DNA under normoxic conditions. During hypoxia E2F-1 activity increased where as p65 NF-κB protein levels were decreased. ChIP analysis revealed increased binding of E2F-1 to the Bnip3 promoter during hypoxia which coincided with a 3.5 fold increase in Bnip3 gene transcription. IKKβ mediated activation of NF-κB activation abrogated hypoxia-induced E2F-1 binding to the Bnip3 promoter and Bnip3 gene transcription. To our knowledge our data provide the first direct evidence that a novel relationship exists between p65 NF-κB and E2F-1 for basal and hypoxia-inducible regulation of the Bnip3 promoter. Furthermore, our data highlight a novel survival pathway by which NF-κB averts hypoxia - induced cell death by antagonizing the E2F-1 dependent transcription of Bnip3 in ventricular myocytes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».