Parkin and CASK/LIN-2 Associate via a PDZ-mediated Interaction and Are Co-localized in Lipid Rafts and Postsynaptic Densities in Brain
Notice bibliographique
Résumé
Mutations in the gene encoding parkin cause an autosomal recessive juvenile-onset form of Parkinson's disease. Parkin functions as a RING-type E3 ubiquitin-ligase, coordinating the transfer of ubiquitin to substrate proteins and thereby targeting them for degradation by the proteasome. We now report that the extreme C terminus of parkin, which is selectively truncated by a Parkinson's disease-causing mutation, functions as a class II PDZ-binding motif that binds CASK, the mammalian homolog of Caenorhabditis elegans Lin-2, but not other PDZ proteins in brain extracts. Importantly, parkin co-localizes with CASK at synapses in cultured cortical neurons as well as in postsynaptic densities and lipid rafts in brain. Further, parkin associates not only with CASK but also with other postsynaptic proteins in the N-methyl d-aspartate (NMDA) receptor-signaling complex, in rat brain in vivo. Finally, despite exhibiting E2-dependent ubiquitin ligase activity, rat brain parkin does not ubiquitinate CASK, suggesting that CASK may function in targeting or scaffolding parkin within the postsynaptic complex rather than as a direct substrate for parkin-mediated ubiquitination. These data implicate for the first time a PDZ-mediated interaction between parkin and CASK in neurodegeneration and possibly in ubiquitination of proteins involved in synaptic transmission and plasticity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».