A Single Bifunctional UDP-GlcNAc/Glc 4-Epimerase Supports the Synthesis of Three Cell Surface Glycoconjugates in Campylobacter jejuni
Notice bibliographique
Résumé
The major cell-surface carbohydrates (lipooligosaccharide, capsule, and glycoprotein N-linked heptasaccharide) of Campylobacter jejuni NCTC 11168 contain Gal and/or GalNAc residues. GalE is the sole annotated UDP-glucose 4-epimerase in this bacterium. The presence of GalNAc residues in these carbohydrates suggested that GalE might be a UDP-GlcNAc 4-epimerase. GalE was shown to epimerize UDP-Glc and UDP-GlcNAc in coupled assays with C. jejuni glycosyltransferases and in sugar nucleotide epimerization equilibria studies. Thus, GalE possesses UDP-GlcNAc 4-epimerase activity and was renamed Gne. The Km(app) values of a purified MalE-Gne fusion protein for UDP-GlcNAc and UDP-GalNAc are 1087 and 1070 microm, whereas those for UDP-Glc and UDP-Gal are 780 and 784 microm. The kcat and kcat/Km(app) values were three to four times higher for UDP-GalNAc and UDP-Gal than for UDP-GlcNAc and UDP-Glc. The comparison of the kinetic parameters of MalE-Gne to those of other characterized bacterial UDP-GlcNAc 4-epimerases indicated that Gne is a bifunctional UDP-GlcNAc/Glc 4-epimerase. The UDP sugar-binding site of Gne was modeled by using the structure of the UDP-GlcNAc 4-epimerase WbpP from Pseudomonas aeruginosa. Small differences were noted, and these may explain the bifunctional character of the C. jejuni Gne. In a gne mutant of C. jejuni, the lipooligosaccharide was shown by capillary electrophoresis-mass spectrometry to be truncated by at least five sugars. Furthermore, both the glycoprotein N-linked heptasaccharide and capsule were no longer detectable by high resolution magic angle spinning NMR. These data indicate that Gne is the enzyme providing Gal and GalNAc residues with the synthesis of all three cell-surface carbohydrates in C. jejuni NCTC 11168.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».