Retrospective study to determine the correlation between the organism load of toxigenic Clostridium difficile and the C. difficile-associated disease
Notice bibliographique
Résumé
Background: Clostridium difficile-associated disease (CDAD) is a leading cause of nosocomial diarrhea in adults. Therefore, rapid and accurate reporting of C. difficile is essential. Rapid PCR-based in-house and commercial methods that are highly sensitive and specific are now available. However, PCR-based methods will only detect the presence of toxigenic C. difficile and could be carried by patients without CDAD symptoms. In these cases, the PCR may be presumed as a false-positive test for the disease. The objective of this study is to examine the correlation between the CDAD clinical outcome and the amount of toxigenic C. difficile load and to predict whether there is a relationship between the number of organisms present in patients with CDAD to assist clinicians in their interpretation of results and in making clinical decisions. Methods: The clinical information from 200 randomly selected patients tested positive for the toxigenic C. difficile by a Real-Time Multiplex PCR that detects tcdC and cdtA genes were evaluated. The organism loads were calculated as genomic equivalents by a semi-quantitative real-time C. difficile PCR assay using known concentrations of genomic DNA. The organism load was grouped into high, moderate, and low based on the cycle threshold (CT) values. Patient chart reviews were used to collect multiple variables including age, sex, previous CDAD, previous antibiotic use, underlying medical conditions, and laboratory parameters. Results: The patients aged from 1 year to 95 years with a mean of 60 years and a median of 71 years. Fifty-five percent of the patients were female and 45% were male. Among toxigenic C. difficile strains 39% were NAP1. Most ealderly patients had comorbidities. The majority (81%) had moderate organism loads. Only 15% and 4% had high and low organism loads, respectively. Previous CDAD and the presence of NAP1 gene was noted more in patients with high organism loads. The mortality in high organism load group was 20% compared to none in the low organism load group. All deaths were associated with the NAP1 strain in high organism load group with multiple co-morbidities. Conclusion: High organism load is associated with the presence of NAP1 strain which increases the excessive toxin production leading to poor outcome in elderly patients with multiple underlying co-morbidities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».