The Arabidopsis SWI2/SNF2 Chromatin Remodeler BRAHMA Regulates Polycomb Function during Vegetative Development and Directly Activates the Flowering Repressor Gene SVP
Notice bibliographique
Résumé
The chromatin remodeler BRAHMA (BRM) is a Trithorax Group (TrxG) protein that antagonizes the functions of Polycomb Group (PcG) proteins in fly and mammals. Recent studies also implicate such a role for Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) BRM but the molecular mechanisms underlying the antagonism are unclear. To understand the interplay between BRM and PcG during plant development, we performed a genome-wide analysis of trimethylated histone H3 lysine 27 (H3K27me3) in brm mutant seedlings by chromatin immunoprecipitation followed by next generation sequencing (ChIP-seq). Increased H3K27me3 deposition at several hundred genes was observed in brm mutants and this increase was partially supressed by removal of the H3K27 methyltransferase CURLY LEAF (CLF) or SWINGER (SWN). ChIP experiments demonstrated that BRM directly binds to a subset of the genes and prevents the inappropriate association and/or activity of PcG proteins at these loci. Together, these results indicate a crucial role of BRM in restricting the inappropriate activity of PcG during plant development. The key flowering repressor gene SHORT VEGETATIVE PHASE (SVP) is such a BRM target. In brm mutants, elevated PcG occupancy at SVP accompanies a dramatic increase in H3K27me3 levels at this locus and a concomitant reduction of SVP expression. Further, our gain- and loss-of-function genetic evidence establishes that BRM controls flowering time by directly activating SVP expression. This work reveals a genome-wide functional interplay between BRM and PcG and provides new insights into the impacts of these proteins in plant growth and development.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».