Fep1 represses expression of the fission yeast Schizosaccharomyces pombe siderophore-iron transport system
Notice bibliographique
Résumé
When iron repletes, Schizosaccharomyces pombe cells repress transcription of genes encoding components involved in the reductive iron transport system. Fep1 mediates this transcriptional control by interacting specifically with GATA-type cis-acting elements. To further investigate the role that Fep1 plays in iron homeostasis, we searched for additional Fep1-regulated genes. We found that str1+ is subject to negative transcriptional regulation, which is exerted through binding of Fep1 to a single GATA element in the str1+ promoter. Introduction of str1+ into a Saccharomyces cerevisiae fet3Delta arn1-4Delta strain led to assimilation of iron from ferrichrome, revealing that Str1 functions as a siderophore-iron transporter in S.pombe. We also identified two additional target genes of Fep1, named str2+ and str3+. We demonstrate that the str1+, str2+ and str3+ genes share a common promoter element, 5'-(A/T)GATAA-3'. We found that the N-terminal 241 residue segment of Fep1 expressed in Escherichia coli specifically interacts with the 5'-(A/T)GATAA-3' element present in each of these promoters. Consistent with this, constitutive high level str1+, str2+ and str3+ gene expression was observed in a fep1Delta mutant strain. Taken together, these results demonstrate that Fep1 occupies a central role in coordinating transcriptional regulation of genes encoding components of the reductive and non-reductive iron transport systems in fission yeast.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».