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Enregistrement W1974768814 · doi:10.5511/plantbiotechnology.27.349

The floral inoculating protocol: a simplified Arabidopsis thaliana transformation method modified from floral dipping

2010· article· en· W1974768814 sur OpenAlexaff
Mari Narusaka, Tomonori Shiraishi, Masaki Iwabuchi, Yoshihiro Narusaka

Notice bibliographique

RevuePlant Biotechnology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant tissue culture and regeneration
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransformation (genetics)Arabidopsis thalianaBiologyAgrobacteriumAgrobacterium tumefaciensInoculationBotanyArabidopsisHorticultureGeneGeneticsMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The floral dip protocol mediated by Agrobacterium tumefaciens is the most widely used transformation method for Arabidopsis thaliana. The “floral dip” process in which A. thaliana flower buds are dipped in an Agrobacterium cell suspension requires large volumes of bacterial cultures grown in liquid media, large shakers and centrifuges, and experimental space for them. These factors limit the number of transformations that can occur at once. We established that A. thaliana can be transformed by inoculating 5 μl of Agrobacterium cell suspension in flower buds, thus avoiding the use of large volumes of Agrobacterium culture. Using this modified protocol, we obtained 15–50 transgenic plants per transformation from each pot containing 3 A. thaliana plants. The protocol is satisfactory to be used for subsequent analyses. This simplified method, without floral dipping, which requires large volumes of Agrobacterim culture, offers as efficient a transformation as previously reported protocols. This method reduces the required workload, cost, time, and space. Furthermore, an important aspect of this modified protocol is that it allows many independent transformations to be performed at once.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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