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Enregistrement W1974784717 · doi:10.1021/am502138n

A General Strategy to Create RNA Aptamer Sensors Using “Regulated” Graphene Oxide Adsorption

2014· article· en· W1974784717 sur OpenAlexafffund
Jinping Song, Pui Sai Lau, Meng Liu, Shaomin Shuang, Chuan Dong, Yingfu Li

Notice bibliographique

RevueACS Applied Materials & Interfaces · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAptamerGrapheneRNAFluorophoreMaterials scienceNanotechnologyMolecular beaconAdsorptionFluorescenceNucleic acidDNAQuenching (fluorescence)BiosensorOligonucleotideOxideCombinatorial chemistryBiophysicsChemistryBiologyBiochemistryMolecular biologyOrganic chemistryPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aptamers have been used as molecular recognition elements for sensor development in combination with graphene oxide (GO), a nanomaterial with properties including fluorescence quenching, and selective adsorption of single-stranded nucleic acids. However, previous sensor designs based on aptamer-GO adsorption have not demonstrated wide applicability, and few studies have explored the potential of RNA aptamers. Herein, we present a new sensing strategy based on "regulated" GO adsorption that can accommodate various RNA aptamers. First, adsorption of a fluorophore-labeled RNA aptamer to GO results in fluorescence quenching due to close proximity of the fluorophore to GO. The addition of a complementary, "blocking" DNA strand (BDNA) that hybridizes to the 3'-end of the aptamer, weakens aptamer-GO interaction, and enables increased fluorescent signal generation upon the addition of target, as the sensing system becomes completely separated from GO. Our findings can be applied toward different aptamers, and adapted to enhance generality of existing sensing applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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