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Enregistrement W1974873233 · doi:10.1142/s0219720013410059

ENHANCING GENOMICS INFORMATION RETRIEVAL THROUGH DIMENSIONAL ANALYSIS

2013· article· en· W1974873233 sur OpenAlexaff
Qinmin Hu, Jimmy Xiangji Huang

Notice bibliographique

RevueJournal of Bioinformatics and Computational Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAdvanced Graph Neural Networks
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesUniversité de NeuchâtelUniversity of Melbourne
Mots-clésComputer scienceLinear subspaceInformation retrievalDimension (graph theory)Rank (graph theory)Homogeneity (statistics)GraphData miningSet (abstract data type)GenomicsTheoretical computer scienceMachine learningMathematicsGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We propose a novel dimensional analysis approach to employing meta information in order to find the relationships within the unstructured or semi-structured document/passages for improving genomics information retrieval performance. First, we make use of the auxiliary information as three basic dimensions, namely "temporal", "journal", and "author". The reference section is treated as a commensurable quantity of the three basic dimensions. Then, the sample space and subspaces are built up and a set of events are defined to meet the basic requirement of dimensional homogeneity to be commensurable quantities. After that, the classic graph analysis algorithm in the Web environments is applied on each dimension respectively to calculate the importance of each dimension. Finally, we integrate all the dimension networks and re-rank the outputs for evaluation. Our experimental results show the proposed approach is superior and promising.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0060,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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