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Enregistrement W1974885234 · doi:10.1186/1471-2180-13-77

TypA is involved in virulence, antimicrobial resistance and biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa

2013· article· en· W1974885234 sur OpenAlexafffund
Anke Neidig, Amy Yeung, Thibaut Rosay, Beatrix Tettmann, Nikola Strempel, Martina Rueger, Olivier Lesouhaitier, Joerg Overhage

Notice bibliographique

RevueBMC Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCystic Fibrosis CanadaKarlsruhe Institute of Technology
Mots-clésVirulencePseudomonas aeruginosaMicrobiologyBiologyBiofilmAntibiotic resistanceMutantPathogenTetracyclineAntibioticsType three secretion systemAntimicrobialHuman pathogenBacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Pseudomonas aeruginosa is an important opportunistic human pathogen and is extremely difficult to treat due to its high intrinsic and adaptive antibiotic resistance, ability to form biofilms in chronic infections and broad arsenal of virulence factors, which are finely regulated. TypA is a GTPase that has recently been identified to modulate virulence in enteric Gram-negative pathogens. RESULTS: Here, we demonstrate that mutation of typA in P. aeruginosa resulted in reduced virulence in phagocytic amoebae and human macrophage models of infection. In addition, the typA mutant was attenuated in rapid cell attachment to surfaces and biofilm formation, and exhibited reduced antibiotic resistance to ß-lactam, tetracycline and antimicrobial peptide antibiotics. Quantitative RT-PCR revealed the down-regulation, in a typA mutant, of important virulence-related genes such as those involved in regulation and assembly of the Type III secretion system, consistent with the observed phenotypes and role in virulence of P. aeruginosa. CONCLUSIONS: These data suggest that TypA is a newly identified modulator of pathogenesis in P. aeruginosa and is involved in multiple virulence-related characteristics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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