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Enregistrement W1974981371 · doi:10.1074/jbc.m109.054866

Structural and Functional Characterization of SporoSAG

2010· article· en· W1974981371 sur OpenAlexafffund
Joanna Crawford, Erika Lamb, James D. Wasmuth, Ognjen Grujic, Michael E. Grigg, Martin J. Boulanger

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxoplasma gondii Research Studies
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BCCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésCharacterization (materials science)Computational biologyChemistryBiologyNanotechnologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Toxoplasma gondii, the etiological agent of toxoplasmosis, utilizes stage-specific expression of antigenically distinct glycosylphosphatidylinositol-tethered surface coat proteins to promote and establish chronic infection. Of the three infective stages of T. gondii, sporozoites are encapsulated in highly infectious oocysts that have been linked to large scale outbreaks of toxoplasmosis. SporoSAG (surface antigen glycoprotein) is the dominant surface coat protein expressed on the surface of sporozoites. Using a bioinformatic approach, we show that SporoSAG clusters with the SAG2 subfamily of the SAG1-related superfamily (SRS) and is non-polymorphic among the 11 haplogroups of T. gondii strains. In contrast to the immunodominant SAG1 protein expressed on tachyzoites, SporoSAG is non-immunogenic during natural infection. We report the 1.60 Å resolution crystal structure of SporoSAG solved using cadmium single anomalous dispersion. SporoSAG crystallized as a monomer and displays unique features of the SRS β-sandwich fold relative to SAG1 and BSR4. Intriguingly, the structural diversity is localized to the upper sheets of the β-sandwich fold and may have important implications for multimerization and host cell ligand recognition. The structure of SporoSAG also reveals an unexpectedly acidic surface that contrasts with the previously determined SAG1 and BSR4 structures where a basic surface is predicted to play a role in binding negatively charged glycosaminoglycans. Our structural and functional characterization of SporoSAG provides a rationale for the evolutionary divergence of this key SRS family member. Toxoplasma gondii, the etiological agent of toxoplasmosis, utilizes stage-specific expression of antigenically distinct glycosylphosphatidylinositol-tethered surface coat proteins to promote and establish chronic infection. Of the three infective stages of T. gondii, sporozoites are encapsulated in highly infectious oocysts that have been linked to large scale outbreaks of toxoplasmosis. SporoSAG (surface antigen glycoprotein) is the dominant surface coat protein expressed on the surface of sporozoites. Using a bioinformatic approach, we show that SporoSAG clusters with the SAG2 subfamily of the SAG1-related superfamily (SRS) and is non-polymorphic among the 11 haplogroups of T. gondii strains. In contrast to the immunodominant SAG1 protein expressed on tachyzoites, SporoSAG is non-immunogenic during natural infection. We report the 1.60 Å resolution crystal structure of SporoSAG solved using cadmium single anomalous dispersion. SporoSAG crystallized as a monomer and displays unique features of the SRS β-sandwich fold relative to SAG1 and BSR4. Intriguingly, the structural diversity is localized to the upper sheets of the β-sandwich fold and may have important implications for multimerization and host cell ligand recognition. The structure of SporoSAG also reveals an unexpectedly acidic surface that contrasts with the previously determined SAG1 and BSR4 structures where a basic surface is predicted to play a role in binding negatively charged glycosaminoglycans. Our structural and functional characterization of SporoSAG provides a rationale for the evolutionary divergence of this key SRS family member.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,318
Score d'incertitude au seuil0,916

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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