<i><scp>B</scp>rassica napus </i><scp><i>TT16</i></scp> homologs with different genomic origins and expression levels encode proteins that regulate a broad range of endothelium‐associated genes at the transcriptional level
Notice bibliographique
Résumé
The transcription factor TRANSPARENT TESTA 16 (TT16) plays an important role in endothelial cell specification and proanthocyanidin (PA) accumulation. However, its precise regulatory function with regard to the expression of endothelial-associated genes in developing seeds, and especially in the PA-producing inner integument, remains largely unknown. Therefore, we endeavored to characterize four TT16 homologs from the allotetraploid oil crop species Brassica napus, and systematically explore their regulatory function in endothelial development. Our results indicated that all four BnTT16 genes were predominantly expressed in the early stages of seed development, but at distinct levels, and encoded functional proteins. Bntt16 RNA interference lines exhibited abnormal endothelial development and decreased PA content, while PA polymerization was not affected. In addition to the previously reported function of TT16 in the transcriptional regulation of anthocyanidin reductase (ANR) and dihydroflavonol reductase (TT3), we also determined that BnTT16 proteins played a significant role in the transcriptional regulation of five other genes involved in the PA biosynthetic pathway (P < 0.01). Moreover, we identified two genes involved in inner integument development that were strongly regulated by the BnTT16 proteins (TT2 and δ-vacuolar processing enzyme). These results will better our understanding of the precise role of TT16 in endothelial development in Brassicaceae species, and could potentially be used for the future improvement of oilseed crops.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».