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Enregistrement W1975052707 · doi:10.1074/jbc.m512009200

Individual Timp Deficiencies Differentially Impact Pro-MMP-2 Activation

2006· article· en· W1975052707 sur OpenAlexafffund
Jane L. English, Zamaneh Kassiri, Ilpo Koskivirta, Susan J. Atkinson, Marco Di Grappa, Paul D. Soloway, Hideaki Nagase, Eero Vuorio, Gillian Murphy, Rama Khokha

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMatrix metalloproteinaseCell biologyCleavage (geology)ChemistryBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Membrane-type matrix metalloproteinases (MT-MMPs) have emerged as key enzymes in tumor cell biology. The importance of MT1-MMP, in particular, is highlighted by its ability to activate pro-MMP-2 at the cell surface through the formation of a trimolecular complex comprised of MT1-MMP/tissue inhibitor of metalloproteinase-2 (TIMP-2)/pro-MMP-2. TIMPs 1-4 are physiological MMP inhibitors with distinct roles in the regulation of pro-MMP-2 processing. Here, we have shown that individual Timp deficiencies differentially affect MMP-2 processing using primary mouse embryonic fibroblasts (MEFs). Timp-3 deficiency accelerated pro-MMP-2 activation in response to both cytochalasin D and concanavalin A. Exogenous TIMP-2 and N-TIMP-3 inhibited this activation, whereas TIMP-3 containing matrix from wild-type MEFs did not rescue the enhanced MMP-2 activation in Timp-3(-/-) cells. Increased processing of MMP-2 did not arise from increased expression of MT1-MMP, MT2-MMP, or MT3-MMP or altered expression of TIMP-2 and MMP-2. To test whether increased MMP-2 processing in Timp-3(-/-) MEFs is dependent on TIMP-2, double deficient Timp-2(-/-)/-3(-/-) MEFs were used. In these double deficient cells, the cleavage of pro-MMP-2 to its intermediate form was substantially increased, but the subsequent cleavage of intermediate-MMP-2 to fully active form, although absent in Timp-2(-/-) MEFs, was detectable with combined Timp-2(-/-)/-3(-/-) deficiency. TIMP-4 associates with MMP-2 and MT1-MMP in a manner similar to TIMP-3, but its deletion had no effect on pro-MMP-2 processing. Thus, TIMP-3 provides an inherent regulation over the kinetics of pro-MMP-2 processing, serving at a level distinct from that of TIMP-2 and TIMP-4.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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