MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1975403486 · doi:10.5539/jas.v4n9p48

Comparative Proteome Analysis of Porcine Longissimus dorsi on the Basis of pH24 of Post-mortem Muscle

2012· article· en· W1975403486 sur OpenAlexvenueno aff
Ju-Hyun Nam, Dong‐Gi Lee, Joseph Sang‐Il Kwon, Chi-Won Choi, Seong Hwa Park, Sang‐Oh Kwon, Jong Hyun Jung, Hwa Choon Park, Beom Young Park, Ik‐Soon Jang, Woo Young Bang, Chul Wook Kim, Jong‐Soon Choi

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMeat and Animal Product Quality
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Education, Science and TechnologyNational Research Foundation of KoreaNational Research FoundationKorea Basic Science InstituteMinistry for Food, Agriculture, Forestry and FisheriesRural Development Administration
Mots-clésLongissimus dorsiProteomeShotgunGene ontologyBiologyShotgun proteomicsTandem mass spectrometryProteomicsBiochemistryGeneChemistryMass spectrometryChromatographyGene expressionFood science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To identify proteins contributing to meat quality, a comparative shotgun proteomic profiling of Berkshire longissimus dorsi muscles was conducted in high pH group (HpHG) and low pH group (LpHG) based on 24 hour post-mortem pH. Triplicate liquid chromatography–tandem mass spectrometry analysis identified a total of 208 and 204 proteins in the HpHG and LpHG, respectively. A total of 128 proteins were classified on the basis of molecular function, cellular components, and biological process by gene ontology analysis, of which 13 and 21 proteins were exclusively found in the HpHG and LpHG, respectively. A total of 15 proteins, of which 6 proteins belonged to the LpHG and 2 to the HpHG, were assigned to the Sus scrofa genomic database. The dominant expressions of Igc, Prep, Ldhb, and Aco2 were identified in the LpHG by shotgun proteomic analysis, and confirmed by reverse transcriptase–mediated polymerase chain reaction analysis. These protein markers are suitable for determining meat quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Agricultural ScienceMême sujetMeat and Animal Product QualityTravaux en français237 207