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Enregistrement W1975411599 · doi:10.1371/journal.pone.0072264

The MicroRNAome of Pregnancy: Deciphering miRNA Networks at the Maternal-Fetal Interface

2013· article· en· W1975411599 sur OpenAlexafffund
Jocelyn M. Wessels, Andrew K. Edwards, Kasra Khalaj, Rami T. Kridli, Mallikarjun Bidarimath, Chandrakant Tayade

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésConceptusmicroRNABiologyFetusMicroarrayEndometriumAndrologyMicroarray analysis techniquesGene expressionPregnancyAngiogenesisRegulation of gene expressionBioinformaticsGeneGeneticsEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) post-transcriptionally regulate a vast network of genes by inhibiting mRNA translation. Aberrant miRNA expression profiles have been implicated in pathologies and physiological processes including pregnancy and angiogenesis. Using our established model of implantation failure and spontaneous fetal loss in pigs (Sus scrofa), 236 miRNAs were profiled and compared between 1) non-pregnant and pregnant endometrium, 2) maternal and fetal tissues, and 3) viable and growth-arrested conceptus attachment sites by microarray and Real-Time PCR. Many significant differences in miRNA expression were observed between each of the aforementioned comparisons, and several were validated by PCR. Results indicated which miRNAs were important during pregnancy, which were elevated on the maternal or fetal side of the maternal-fetal interface, and they implicated the maternal expression of miR-10a, 27a, 29c, 323, 331-5p, 339-3p, 374b-5p, and 935 in the spontaneous loss observed in pigs. Several putative mRNA targets of the miRNAs (elevated in endometrium associated with arresting conceptuses) were assessed by quantitative Real-Time PCR and were depressed, supporting their regulation by miRNAs. Finally, targets were clustered by function to obtain ranked lists of gene networks that indicated which pathways/physiological processes might be important in non-pregnant (extracellular matrix factors) versus pregnant endometrium (nuclear transcription factor regulation), maternal (blood vessel development) versus fetal (neuronal differentiation) tissue, and healthy (extracellular matrix factors) versus arresting (GRAM domain) conceptus attachment sites. Overall, we demonstrate the presence of miRNAs on both sides of the maternal-fetal interface, implicate them in spontaneous fetal loss, and present a unique glimpse into the vast microRNAome of pregnancy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,260

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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