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Enregistrement W1975444171 · doi:10.1002/cyto.a.20346

Proapoptotic effects of NARC 1 (= PCSK9), the gene encoding a novel serine proteinase

2006· article· en· W1975444171 sur OpenAlexaff
Brendan Bingham, Ru Shen, Smita Kotnis, C. Frederick Lo, Bradley A. Ozenberger, Nivedita Ghosh, Jeffrey D. Kennedy, J. Steven Jacobsen, Jill M. Grenier, Peter S. DiStefano, Lillian W. Chiang, Andrew Wood

Notice bibliographique

RevueCytometry Part A · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensWomen's Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerineProgrammed cell deathBiologyMolecular biologyTransfectionApoptosisMutantCell biologyCell cultureGeneBiochemistryGeneticsPhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: NARC 1/PCSK9 encodes a novel serine proteinase known to play a role in cholesterol homeostasis. NARC 1 mRNA expression in cerebellar granule neurons (CGNs) was discovered to be induced following an apoptotic injury. Coregulation of known apoptotic mediators (caspase-3 and death receptor 6) raises the possibility that NARC 1 might be involved in the propagation of apoptotic signaling in neurons. METHODS: CGNs were transfected with EGFP-fusion constructs of wild-type and mutant NARC 1, and a laser scanning cytometry-based method of scoring cell death in transfectants was applied. Use of the poly-caspase inhibitor BAF allowed assessment of the caspase-dependence of the NARC 1 proapoptotic effect. RESULTS: Wild-type NARC 1 was found to have substantial proapoptotic effects that were only partially reversible by BAF. Mutation of the active site serine or deletion of the catalytic domain resulted in a reduced level of cell death, consistent with loss of the BAF-sensitive component of cell death. NH(2)-terminal deletion constructs of NARC 1 had effects similar to wild-type, both in the absence and presence of BAF, whereas expression of COOH-terminal deletion mutants produced a rate of cell death similar to wild-type in the absence of BAF treatment, but which lacked the capacity to be reduced by treatment with BAF. CONCLUSION: The mechanism by which NARC 1-EGFP over-expression induces cell death in cultured CGNs remains unclear. Mutation analysis established a positive correlation between the presence of the Narc 1 active site serine in the transiently expressed protein and induction of the BAF-sensitive component of the cell death phenotype. A caspase-independent component proved sufficiently complex to map discretely within the Narc 1 protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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