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Enregistrement W1975476455 · doi:10.1063/1.4813803

Low absorption state of phycocyanin from <i>Acaryochloris marina</i> antenna system: On the interplay between ionic strength and excitonic coupling

2013· article· en· W1975476455 sur OpenAlexaff
Collins Nganou

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Chemical Physics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensCape Breton University
Organismes subventionnairesDeutscher Akademischer Austauschdienst
Mots-clésExcited stateIonic strengthIonic bondingChemistryOscillator strengthDelocalized electronKinetic energyMaterials scienceAnalytical Chemistry (journal)PhotochemistryAtomic physicsPhysical chemistryIonPhysicsSpectral line

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This paper studies the excitonic factor in the excited state energy transfer of phycobilisome (PBS) by using a polarized time-resolved pump-probe and by changing the ionic strength of the cofactors' medium in the PBS of Acaryochloris marina (A. marina). As a result, the interplay between the surrounding medium and the closely excited adjacent cofactors is shown to be a negligible factor of the excitonic decay kinetics at 618 nm of the phycocyanin (PC), while it appears as a driving factor of an increase in excitonic delocalization at 630 nm. The obtained anisotropy values are consistent with the contribution of ionic strength in the excitonic mechanism in PBS. These values were 0.38 in high ionic strength and 0.4 in low ionic strength at 618 nm, and 0.52 in high ionic strength and 0.4 in low ionic strength at 630-635 nm. The anisotropy value of 0.52 in high phosphate is similar at 630 nm and 635 nm, which is consistent with an excitonic delocalization band at 635 nm. The 635 nm band is suggested to show the true low energy level of PC in A. marina PBS. The anisotropy decay kinetic at 630 nm suggests that the excited state population of PC is not all equilibrated in 3 ps because of the existence of the 10 ps decay kinetic component. The presence of the slow kinetic decay component in high, and low ionic strength, is consistent with a 10 and 14 ps energy transfer pathway, while the 450 fs kinetic decay component is consistent with the presence of an additional excitation energy transfer pathway between adjacent α84 and β84. Furthermore, the 450 fs decay kinetic is suggested to be trapped in the trimer, while the 400 fs decay kinetic rules out an excitonic flow from low energy level PC to allophycoyanin. This excitonic flow may occur between β84 in adjacent trimers, towards the low energy state of the PBS rod.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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